音乐学院现为自治区级“音乐与舞蹈学”重点学科建设点，拥有自治区高校人文社科重点研究基地“新疆民间音乐研究中心”，“自治区级实践教学示范中心”，民族器乐表演专业方向为“国家级特色专业建设点”。近五年共获批各级科研项目54余项，出版专著12部，发表学术论文148余篇。

音乐学院现有专任教师61人，其中副高级职称教师22人，正高级职称教师6人，硕士学位教师39人，博士以上学历6人。拥有国务院特殊津贴专家、自治区四个一批人才、自治区教学能手等各类荣誉称号专家10余人次。设有音乐表演系、音乐教育系、中国传统音乐系、音乐理论教学部4个教学单位。

本科教育设有音乐表演、音乐学、音乐教育、作曲与作曲技术理论、录音艺术5个专业，研究生教育设艺术学学术型硕士点和音乐专业型硕士点两个学位点。获批“国家一流本科专业”一项，“自治区一流本科专业”一项，“自治区一流本科课程”二门。

在学校党委支持下与中国交响乐团、新疆艺术剧院民族乐团等多家单位签订合作框架协议，为学生提供实践基地。

音乐学院现拥有高水平青年管弦乐团、民族乐团、合唱团、现代爵士乐团四大艺术实践乐团。近些年来在实践展演方面屡获大奖，音乐学院师生获中国音乐“金钟奖”、“文华奖”、“全国普通高等学校音乐教育专业本科学生基本功大赛”全能奖、“第八届全国高等艺术院校民族声乐”银奖等、1项教学成果获国家教学成果二等奖、2项获自治区教学成果一等奖，各类省级以上奖项近300项。